『南の壁：モーゼスの物語』

南側の壁：モーセの生涯

南壁には、部屋の向かい側に描かれたキリストの生涯の物語に対応する、旧約聖書の物語である「モーセの生涯」が描かれている。この2つの壁は、場面と場面が呼応し合う対をなすものとして計画されており、モーセの生涯の各場面が、向かい側のキリストの生涯の場面と対応している。構成も同様に3つの帯からなる：下部には描かれた垂れ幕、中央にはモーセの物語、窓の間には教皇たち、そして上部のルネットにはキリストの先祖たちが描かれている。

かつてこの連作は、祭壇壁面に描かれたペルジーノ作の 『モーセの誕生と発見』から始まっていた。しかし、ミケランジェロが『最後の審判』を描いた際にその作品は失われてしまったため、現在ではモーセがエジプトへ向かう場面から物語が始まっている。

『モーセの物語』

現存するパネルは、預言者の生涯をたどっており、多くの場合、複数のエピソードが1つの枠にまとめられている。最初のパネルは「モーセのエジプトへの旅」を描いており、イトロとの別れや息子の割礼の場面が描かれている。続いて、彼の若い頃の出来事が描かれている：エジプト人の殺害、井戸でのイトロの娘たちの救出、そして燃える荊棘の場面である。

3番目のパネルは「紅海の横断」であり、続いてシナイ山での「十戒の石板の授与」が描かれています。この場面には、黄金の子牛への崇拝や、石板の破壊と再作成の場面も織り込まれています。次に、モーセとアロンに反抗したために大地に飲み込まれた3人の男、コラ、ダタン、アビラムの「懲罰」という珍しい題材が描かれ、最後に「約束の地」を目前にしてモーセが亡くなる場面が続きます。 この連作は、角を曲がった入口の壁面に描かれた「モーセの遺体をめぐる論争」で締めくくられている。

ルネット：キリストの先祖たち

南側の窓の上にあるルネットには、礼拝堂全体を囲むのと同じ長い系図である、ミケランジェロの『キリストの先祖たち』が描かれている。彼はこれらを、英雄的な肖像画というよりは、静かな家族の群像として描いた。待ちわびる人々、うたた寝する人々、子供たちの世話をしている人々といった姿が、無地の背景を背景に描かれている。北側と同様に、刻まれた名前が特定の登場人物を明確に指し示すことはめったになく、その人物の特定については議論の余地が残されている。

窓の間に描かれた教皇たち

初期の教皇たちの列もこの壁に沿って並んでおり、向かい側の像と交互に配置されているため、この一連の絵は部屋の一方の側面に沿って下から上へとではなく、部屋を横断するように鑑賞されるようになっている。ペルジーノ、ボッティチェッリ、ロッセッリ、ギルランダイオによって描かれた各教皇は、ニッチの中に三分の二の横顔で立ち、本を手にしていたり、祝福を与えたりしている。これは、モーセからキリストへと続く権威が、ローマの司教たちの系譜を通じて受け継がれていることを視覚的に主張するものである。

その下の偽のカーテン

モーセの場面の下には、礼拝堂の周囲一帯に見られるのと同じ、描かれた垂れ幕の帯が走っている。それぞれが硬質なブロケードを模した陰影が施され、オークの紋章とシクストゥス4世の名前が記されている。この帯は、後に祝日にラファエロの織物タペストリーが掛けられるために確保された部分であり、そのため壁の最下部には、教皇の名を冠するこの礼拝堂に、常にデッラ・ロヴェーレ家の印が刻まれていたのである。